Клинико-диагностическая лаборатория состоит из клинического и биохимического отделов. Она была организована одновременно с больницей. Первой заведующей лабораторией была Лидия Августовна Якобсон. В 1972 году ее сменила Дудина Раиса Леонидовна. С 2003 года лабораторией заведует Янцен Евгения Валентиновна. Сейчас в лаборатории работают 3 врача, имеющие высшую и первую категории. Практически все лаборанты имеют высшую категорию.
В биохимическом отделе выполняется более 70 видов исследований. В клиническом отделе, выполняются современные высокоинформативные исследования. Каждый год происходит замена устаревших методик на современные.
Лаборатория оснащена современным оборудованием: имеются гематологические, мочевые, биохимические анализаторы, анализаторы глюкозы, автоматический коагулометр, аппарат для электрофореза белков. Это позволяет выполнять качественно и достаточно быстро большой спектр исследований.